最近碰到一个问题相当疑惑，希望能在这里找到答案，请各位帮忙看一下。

假设1月份业务：收到A公司货物，货物成本100，关税13，进口运费20。
理论上应该通过应收应付系统录入这样几张凭证：

①借 库存商品 100
贷 应付账款-A 100
②借 库存商品 10
贷 应付账款（关税）10
③借 库存商品 20
贷 应付账款（运费）20

以上三张凭证应该相互勾稽。

但是当时记账会计是个坑，她的做法如下：

①借 库存商品 80
贷 应付账款-A 80 （通过应收应付系统）
②借 库存商品 10
贷 应付账款（关税）10（手动录入，未通过应收应付系统）
③运费部分未记账。

这样一来凭证之间也没有相互勾稽，结果是A公司往来账对不上，库存商品也不对，对应的成本也不对。

我想了很久怎么把账做平，目前的方案是，
①补录成本为20的应付账款，然后将库存商品结转至目前期间成本（手动录入，不通过应收应付系统）；
②将关税10结转为当期成本（手动录入，不通过应收应付系统）；
③补录运费，并结转至当期成本（手动录入，不通过应收应付系统）

也就是说不通过应收应付系统，手动将A公司的应付账以及1月的库存商品和对应成本调回来。

问题是，这样做账似乎是平了，有什么后果？就是对总账，明细账，还有业务系统相关账目会有什么影响？