会计科目原材料余额为负的原因可能有以下几点：

1. 原材料到货未入库：公司可能有原材料到货，但由于没有收到发票，财务上没有进行入库操作。然而，在领用的时候，财务的帐上面却发生了出库，导致当月原材料账上贷方发生额大于借方发生额，使得月底余额在贷方，呈现负数。

2. 漏记原材料购进：可能存在漏记的原材料购进情况，即实际上有原材料购入，但在记账时遗漏了，导致原材料的发出大于购进，出现原材料余额为负。

3. 赊购原材料未入账：如果存在赊购的原材料未及时入账，也会造成原材料的发出大于购进，从而出现原材料余额为负的情况。

4. 记账错误或管理不当：除了上述原因外，原材料账余额是负数还可能是由于记账错误、管理不当或其他地方做错了或者做漏了导致的。

为了避免原材料余额为负的情况出现，企业应该加强原材料的管理和记账工作，确保原材料的购进、领用和结存都准确无误地反映在账目上。同时，建立科学合理的原料管理体系，实施及时管控和加强管理也是非常重要的。如果原材料余额出现负数，企业应尽快查明原因并采取有效措施进行调整和纠正。