您好，在旗舰版4.2里面 业务流程为 销售订单--销售出库--销售发票
然后做收款单的时候可以多次收款
如：我新增收款单的时候 原单类型选择销售订单 可以把订单进行收款
然后我可以再新增收款单 原单类型选择销售发票 还可以生成一张收款单
这个如何处理？

根据实际业务场景规范业务流程。收款是依据开票金额进行收款的，一般来说开多少票才能收多少款。
已开票的情况下，需要企业规范流程，根据发票生成收款单（关联发票生成的收款单审核后系统会自动核销），根据发票收款后，再录入收款单是选择不到已收款的订单的（系统有控制）。
未开票的业务收款，由于暂时没有发票，录入收款单只能选择订单；后续开票后发票和收款单需要手工核销，已核销的发票则不能再生成收款单。此情形下，需要人为规范流程，进行核销。如果未核销，开票后再选择发票生成收款单，就会造成收款单重复；不过财务人员对于一笔收款，应该是根据实际收款的业务凭据入账，而不是根据订单和发票去录入收款单，正常只会根据银行入账凭据入账一次。

如果是付款业务，此时可能会有部分业务根据采购发票付款，有部分直接根据采购订单付款，为了避免付款重复，系统有参数控制不允许超额付款（采购系统选项---订单允许超额付款）。