成本单价和成本金额的时候。采购单价采购金额不会应为成本金额的改变进行相对应的改变。这个可以设置吗？

不能设置。
单位成本、成本金额在采购环节是不需要去录入和关注的。月末如入库材料的发票没有到，需要进行暂估入账，则在存货核算中录入暂估单价，暂估单价也可以选择根据采购单价进行更新（需打补丁PT102693实现）。